IPA

Incidence parasitaire annuelle : Nombre (pour 1000 habitants) de cas de paludisme, confirmés par un examen microscopique, décelés pendant une année.


levure

Champignon unicellulaire apte à provoquer la fermentation des matières organiques, animales ou végétales, utilisé pour la fermentation alcoolique des solutions sucrées ou pour faire lever la pâte du pain.

L’acétyl-pyrroline provient de l’ornithine ou de la proline. Lors de la cuisson du pain blanc, l’ornithine est produite par la levure, dans laquelle elle apparaît en concentration quatre fois plus élevée que la proline libre.

Werner J. Bauer, Raphaël Badoud, Jürg Löliger, Alain Etournaud (éditeur), Science et technologie des aliments: principes de chimie des constituants et de technologie des procédés, PPUR Presses polytechniques, 2010, page 305


figuré

(Date à préciser) Participe passé adjectivé de figurer.

figurés (plural masculine)
figurée (singular feminine)
figurées (plural feminine)

figurat

Qualifie une écriture, un parler, dans lequel il y a beaucoup de figures, soit de mots, soit de pensée.

Qualifie les éléments d'un liquide corporel qui ont une forme et sont, ainsi, visibles au microscope.

S'il est exact de considérer l’œdème comme une accumulation anormale de lymphe, on peut admettre que la lymphe périphérique est un liquide tout à fait clair, ne contenant aucune trace d'éléments figurés.

Wilhelm Wundt, Nouveaux éléments de physiologie humaine, traduit de l'allemand sur la 2ᵉ édition et augmentée de notes par le Dʳ Bouchard, Paris : chez F. Savy, 1872, p. 203

Ce sont les éléments figurés du sperme qui lui donnent son aspect blanchâtre ou même d'un blanc éclatant comme celui de la laitance des Poissons.

« Collège de France : Cours d'embryogenèse comparée de M. Balbiani », 15ᵉ leçon, dans la Revue Internationale des Sciences Biologiques, dirigée par J.-L. de Lanessan, tome 2, Paris : chez Octave Doin, 1878, p. 610

L'hémorragie aiguë entraîne une perte brutale proportionnelle de plasma et d'éléments figurés du sang. Bien qu'ici le sang total perdu atteigne 2,5 l, soit environ la moitié de la volémie d'un adulte, l'hématocrite reste initialement stable (t1).

Collège des Enseignants de médecine intensive-réanimation, Médecine Intensive, réanimation, urgences et défaillances viscérales aiguës, 6ᵉ éd., Elsevier Masson, 2018, chap.10 : commentaire de la figure 10-2


vacuole

(1736) Dérivé savant du latin vacuus (« vide ») avec le suffixe -ole : « petite cavité », → voir alvéole.

vug

cavité à l'intérieur d'une roche (en géologie)

Vésicule liée à la membrane du cytoplasme d’une cellule.

Alors qu'en milieu normal le rH2 cytoplasmique est compris entre 9 et 12, celui des vacuoles est toujours supérieur à 16, c'est à dire que, tandis que le cytoplasme normal est nettement réducteur, le vacuome hydrophile incorporé se montre oxydant.

Pierre Dangeard, Le vacuome de la cellule végétale : morphologie, vol. 3, part. 4, Éditions Springer 1956, p. 35


germe

Micro-organisme ayant une action nuisible ou pathogène, comme une bactérie, un virus, un champignon.

Les uns admettent que l'atmosphère transporte les germes du corps vibrionnaire; les autres pensent, au contraire, que ces germes se forment spontanément dans la matière fermentescible.

E. Boutmy, « Fermentation », dans le Dictionnaire universel d'histoire naturelle, dirigé par Charles d'Orbigny, 5ᵉ éd., tome 5, Paris : au bureau de l’éditeur, 1867, page 86

Ses soupçons se portèrent sur l’eau, véhicule naturel des germes contagieux.

Louis Pergaud, Un petit logement, dans Les Rustiques, nouvelles villageoises, 1921

À Mogador, nouvelle relâche, […]. C’est là qu’ils embarquèrent la Mort Pourpre, et ils remirent à la voile en emportant les germes pestilentiels.

H. G. Wells, La Guerre dans les airs, 1908, traduction d’Henry-D. Davray et B. Kozakiewicz, Mercure de France, Paris, 1910, page 419 de l’édition de 1921


valve

Chez les diatomées, unité siliceuse à l’extrémité d'un frustule, lequel est formé par deux valves opposées et leur ceinture de liaison.


archée

Forme francisée de Archaea, qui est une forme raccourcie de archaebacteria.

Microorganisme appartenant au troisième grand domaine du vivant outre les bactéries et eucaryotes (longueur cellule 5 μm).

… les statines sont également actives sur les archées, ce qui risque d'être déterminant tant pour la santé humaine que pour celle de la planète. En effet, certaines archées, groupe microbien différent des bactéries, produisent du méthane à partir de l'hydrogène. .

Didier Raoult, « Un remède pour le climat ? », Le Point, nᵒ 2301, 13 octobre 2016, page 20

Les scientifiques pensent à des micro-organismes primitifs unicellulaires comme les archées ou les bactéries qui sont nos plus lointains ancêtres.

AFP, NASA: une nouvelle preuve de vie sur Mars, Le Journal de Québec, 9 août 2023


bactériologie

Composé du préfixe bactério- et du suffixe -logie.

Science qui a pour objet l’étude des bactéries.

La bactériologie médicale est la branche de la microbiologie qui traite des interactions entre les micro-organismes et l’être humain.

Jean-Pierre Flandrois, Bactériologie médicale, 1997


microbien

Dérivé de microbe, avec le suffixe -ien.

microbiens (plural masculine)
microbienne (singular feminine)
microbiennes (plural feminine)

Les composés chimiques ci-dessus indiqués sont des microbicides de degré variable: il n'y a dès lors rien d'étonnant à leur voir suspendre ou arrêter définitivement le processus germinatif, suivant leur degré de nocuité sur la vie microbienne.

Édouard Hackel, Nouvelles recherches sur la germination des graines, dans le Journal de Botanique, 3ᵉ année, nᵒ 20 du 16 octobre 1889, Paris : Librairie J. Lechevalier & au bureau du journal, p. 334

La région du Sahel est soumise à de très fortes variations de pluviométrie, surtout lors du passage de la saison sèche à la saison humide. Ces variations modifient directement l’humidité des sols et par conséquent l’activité microbienne responsable des émissions de composés azotés [notamment d’oxyde d’azote (NO), de protoxyde d’azote (N₂O) et d’ammoniaque (NH₃) via des processus de minéralisation et de nitrification/dénitrification] et de dioxyde de carbone (CO₂) (respiration microbienne à l’issue de la décomposition de la matière organique).

Contribution de la région du Sahel au bilan de l’azote atmosphérique, INSU le 8 mars 2017

Aujourd’hui peu peuplée, la forêt a perdu la majorité de sa population humaine sous le choc microbien de la colonisation européenne.

L’Amazonie : quand la forêt cache l’Homme Carbone 14, le magazine de l'archéologie par Vincent Charpentier le 15 avril 2017

Aux États-Unis, les efforts de l’administration Trump pour affranchir les industries extractives et l’ensemble des activités industrielles de toute réglementation ne pourront manquer d’aggraver la perte des habitats, favorisant le transfert microbien des animaux aux humains.

Sonia Shah, Contre les pandémies, l’écologie, Le Monde diplomatique, mars 2020, p.1, page 21


stentor

Genre de micro-organismes eucaryotes unicellulaires ciliés (Ciliophora), infusoires d’eau douce, et ressemblant à un porte-voix ou une trompette.

Si l’on prend un infusoire assez volumineux, tel que le stentor, et qu’on le coupe en deux moitiés contenant chacune une partie du noyau, chacune des deux moitiés régénère un stentor indépendant.

Henri Bergson, L’Évolution créatrice, 1907


acidophile

Dérivé de acide, avec le suffixe -phile, littéralement « qui aime l’acide ».

Qualifie les microorganismes vivant dans des milieux acides.

Deux catégories d’organismes acidophiles peuvent être distinguées (Johnson 1998, 2007): les acidotolérants (plus rarement nommés acidophiles modérés) et les acidophiles obligatoires.

Béatrice Clouet-d’Orval, Bruno Franzetti, Philippe Oger, Les archées, micro-organismes du troisième domaine du vivant 1: découverte, évolution et diversité des archées, 2024, page 171


acidophile

Microorganisme vivant dans des milieux acides.

Cet hyperthermophile est aussi un acidophile vivant dans des gammes de pH allant de 0,9 à 5,8 pour un optimum à 2-3.

Daniel Prieur, Les bactéries de l’extrême: Des abysses à l’espace, 2014


pseudopode

Dérivé du préfixe pseudo- (« faux »), avec le suffixe -pode (« patte »), littéralement « fausse patte ».

Expansion cytoplasmique de la cellule servant à la locomotion, chez l’amibe, ou à la phagocytose, chez certains protistes et chez les globules blancs macrophages.

Amoeba proteus (protozoaire) : Leur forme varie à chaque instant. Elles utilisent leurs pseudopodes pour se déplacer, mais aussi pour se nourrir. Lors de la phagocytose, le pseudopode entoure la particule ; lors de la pinocytose, les gouttes de liquide pénètrent dans le cytoplasme sous forme de vésicule. Le fonctionnement du pseudopode est tout à fait original : le cytoplasme de l’amibe durcit à l’extérieur de la protubérance, alors qu’il se liquéfie à l’intérieur, si bien que le pied se forme et se défait au fur et à mesure du déplacement.


cytoplasmique

cytoplasmiques (plural masculine feminine)


azurine

Protéine tétramérique de teinte bleue présente chez certaines bactéries (e.g. Pseudomonas, Bordetella, Alcaligenes), et qui, par l’intermédiaire d'un atome de cuivre (Cu) fortement lié à chaque monomère, peut catalyser des réactions d’oxydoréduction avec ses propres sous-unités ou avec des cytochromes, passant d’un état réduit Cu (I) (ion cuivreux) à un état oxydé Cu (II) (ion cuivrique), comme dans la chaîne de dénitrification dans laquelle elle joue un rôle essentiel chez ces bactéries.


colibacille

Entérobactérie gram négative, en batonnet, sans spores, commensale de la flore intestinale et indispensable, mais qui peut provoquer certaines infections urinaires, génitales ou intestinales parfois avec toxicose et même une septicémie.

L’espèce Escherichia coli (colibacilles) joue un rôle prépondérant en raison de sa présence constante et de sa large prédominance sur les autres espèces, elle constitue 80 % des bactéries dans les selles terminales.

L’isolement de colibacilles dans des aliments indique une contamination par des fèces.

Christian Meyer, éditeur scientifique, Dictionnaire des sciences animales, Cirad, Montpellier, France, 2025

C’est autour des tables qu’est née la vogue du colibacille. On se rappelle le grand succès de ce microbe peu après l’exposition des Arts décoratifs de 1925. Si discret fût-il par la retraite où il vivait, il connut la gloire d’être le microbe du jour, celui dont on parle, celui qui est sur toutes les lèvres. De streptocoque, de staphylocoque, de pneumocoque, il n’était plus question. Si l’on était l’objet d’attaques de ces organismes vulgaires, on se gardait de s’en vanter ; on en était un peu honteux. On se flattait au contraire de porter en soi le colibacille du même ton que l’on se fût vanté d’héberger sous son toit un roi détrôné ou quelque célèbre raquette de tennis. Il n’était propos de table ou de salon qui ne fussent assaisonnés de colibacilles.

Maurice Bedel, Mémoire sans malice sur les dames d’aujourd’hui, 1935


autolyse

(1903)Dérivé du préfixe auto-, avec le suffixe -lyse.

https://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/LL-Q150 (fra)-Fabricio Cardenas (BiblioCanet66)-autolyse.wav

Destruction des cellules d’un organisme par les enzymes produits par cet organisme.

La vitesse de l’autolyse et de la putréfaction varie selon la température ambiante.


hétéromite

(XIXᵉ siècle) Mot forgé par Félix Dujardin sur le grec ancien,composé de ἕτερος, héteros (« autre ») et de μίτος, mítos (« fil ») ; comparer avec filaire.

Là, sur les bactéries et principalement sur l’hétéromite, il a pu suivre l’apparition, le développement, l’activité, la nutrition et les métamorphoses qui établissent les caractères probables de l’animalité.

Eugène Bouchut, Journal Officiel, 26 novembre 1876, page 8720, 2ᵉ colonne


oocyte

Ovocyte : gamète femelle qui n’est pas encore arrivé à maturité.


infusoire

(Date à préciser) Du latin infusorium ; voir infusoir.

Micro-organisme unicellulaire vivant en suspension dans l’eau douce ou saumâtre et se nourrissant des infusions végétales.

Plus la substance mise en expérience est putrescible, plus vite, a lieu l'apparition des infusoires.

Les générations spontanées, dans Revue du Monde catholique, 1869, page 384

En juillet survint une période de conjugaison : beaucoup d’infusoires se conjuguèrent même avant, d'avoir entièrement digéré leur nourriture. Dans les cultures à inanition presque tous les individus se conjuguèrent; […].

« Hertwig (R.). — La conjugaison chez Dileptus gigas », dans L'Année biologique, volume 9, Paris : chez Masson, 1907, page 53

Et depuis le temps que le monde dure, que des familles où existe tel défaut sous une forme s’allient à des familles où le même défaut existe sous une autre, ce qui crée une variété particulièrement complexe et détestable chez l’enfant, les égoïsmes accumulés (pour ne parler ici que de l’égoïsme) prendraient une puissance telle que l’humanité entière serait détruite, si du mal même ne naissaient, capables de le ramener à de justes proportions, des restrictions naturelles analogues à celles qui empêchent la prolifération infinie des infusoires d’anéantir notre planète, la fécondation unisexuée des plantes d’amener l’extinction du règne végétal, etc. De temps à autre une vertu vient composer avec cet égoïsme une puissance nouvelle et désintéressée.

Des plissures saillantes et grises remplacèrent l’aimable couleur de fruit mûr qu’elle avait inventée, et toutes ses chairs se rétractèrent doucement, prenant le chemin lent des infusoires.

Jean Vautrin, Je mourrai et j’irai voir mon père, dans le recueil Baby Boom, 1985, p. 237


spicule

Du latin spiculum (« extrémité acérée (dard, pointe, aiguillon,…) »), diminutif de spicum (« épi »).

Protéine en forme d’aiguille entourant certains virus comme les coronavirus.

La structure générale de l’EBV (également appelé HHV-4 pour human herpes virus 4) étudiée en microscopie électronique ne se distingue pas de celle des autres herpèsvirus : génome enroulé autour d’une « bobine » protéique, capside icosaédrique, tégument, enveloppe lipidique dans laquelle sont insérés des spicules constitués de glycoprotéines virales (voir fiche signalétique de l’EBV).

François Denis, Les virus transmissibles de la mère à l’enfant, 1999, page 240

Malheureusement, le développement d’un tel vaccin est confronté à des obstacles majeurs intimement associés aux caractéristiques du virus : sa variabilité, la nature des spicules de son enveloppe et de sa capacité de s’intégrer dans les chromosomes et de revenir latent.

Peter J. Delves, Dennis R. Burton, Seamus J. Martin, Les fondements de l'immunologie, 2008, page 332

Prenons l’exemple du spicule (spike en anglais) du virus SARS-Cov-2, c’est-à-dire la protéine de fusion lui permettant de s’accrocher à nos cellules et de les infecter : plus de dix articles publiés entre mars et juillet 2020 dans les journaux les plus connus (Nature, Science, Cell, PNAS – la bibliographie est accessible ici) ont dévoilé le fonctionnement de cette protéine.

Frédéric Cazals, Les carences de la cryo-microscopie illustrent l’absence de stratégie de la recherche française, Le Monde. Mis en ligne le 00 novembre 2020

«Ce qui arrive actuellement, c’est que le spicule, en changeant, risque de ne pas reconnaître les anticorps qu’on a produits. À ce moment-là, on baisserait l’efficacité du vaccin», indique Jacques Lapierre.

TVA Nouvelles, Nouveau variant: «Ce qui a été détecté, c’est la pointe de l’iceberg», journaldemontreal.com, 27 novembre 2021


mélanophore

Des racines grecques anciennes mélano- (« noir ») et -phore (« qui porte, qui contient »).

Le pigment noir, ou mélanine, qui est le plus important, a pour siège certaines cellules étoilées de derme, les mélanophores, qui peuvent […] déterminer l’assombrissement ou l’éclaircissement de la peau.


cytotoxicité

Dérivé de cytotoxique, avec le suffixe -ité.

Propriété d’un agent chimique ou biologique qui est toxique pour les cellules.

Ces molécules peuvent délivrer des signaux activateurs de cytotoxicité et de synthèse de cytokines.

Jean-Pierre Revillard, Immunologie, 2001


bacilliforme

(Siècle à préciser) → voir bacille et -forme.

bacilliformes (plural masculine feminine)

BACILLIFORME, adj., bacilliformis, baculosus (bacillus, baguette, forma, forme) ; qui a la forme d’une baguette. Cette épithète est donnée aux épines des oursins, quand elles ont une certaine longueur. Ex. Cidarites baculosa.

Antoine-Jacques-Louis Jourdan, Dictionnaire des termes usités dans les sciences naturelles, Société belge de librairie, Bruxelles, 1837, nouvelle édition revue, corrigée et augmentée

Ces éléments bacilliformes ne semblent pas être des bactéries.


germicide

Produit ou objet qui détruit les germes (bactéries, virus, vers, champignons, parasites) pathogènes.

Les mots germicide et antiseptique s’emploient souvent comme synonymes, mais à tort, car il y a une différence dans leur signification exacte.


coli

Par simplification du nom latin de cette bactérie, Escherichia coli.

Escherichia coli ou E. coli ou colibacille.

La culture du bouillon est ensemencée sur un tube de gélose; vingt-quatre heures après, on voit des traînées de coli, semées de colonies rondes de staphylocoques.

Comptes rendus des séances de la Société de biologie de Paris, volume 51, page 572, Masson, 1899


photolithotrophe

Étymologie manquante ou incomplète. Si vous la connaissez, vous pouvez l’ajouter en cliquant ici.

photolithotrophes (plural masculine feminine)

Les micro-organismes photolithotrophes sont classés dans une branche plus large appelé Phototrophes. Ceux-ci puisent leur énergie dans le rayonnement lumineux. Les photolithotrophes se développent dans un milieu purement minéral. Ce sont des donneurs inorganiques d’hydrogène et électrons, utilisant le dioxyde de carbone comme source de carbone.


photolithotrophe

Par substantivation du précédent, organisme photolithotrophe.


photoorganotrophe

Dérivé de organotrophe, avec le préfixe photo-.

photoorganotrophes (plural masculine feminine)

Se dit des bactéries photosynthétiques qui utilisent des molécules organiques comme source de carbone, une molécule organique comme source d’électrons pour la réduction de ce carbone, et la lumière comme source d’énergie.


photoorganotrophe

Par substantivation du précédent, organisme photoorganotrophe.


xenopi

Mycobactérie saprophyte assez répandue, qui donne des colonies jaunes, lisses.

Si l’épidémie (la première dans laquelle le xenopi est le germe responsable) a pris une telle ampleur, c’est que la période de contamination possible s’est étendue sur une période de cinq ans.


azotobacter

En biologie, le genre, premier mot du nom binominal et les autres noms scientifiques (en latin) prennent toujours une majuscule. Par exemple, pour l’être humain moderne : Homo sapiens, famille : Hominidae. Quand ils utilisent des noms en français, ainsi que dans d’autres langues, les naturalistes mettent fréquemment une majuscule aux noms de taxons supérieurs à l’espèce (par exemple : les Hominidés, ou les hominidés).
Un nom vernaculaire ne prend pas de majuscule, mais on peut en mettre une quand on veut signifier que l’on parle non pas d’individus, mais de l’espèce (au sens du couple genre-espèce), du genre seul, de la famille, de l’ordre, etc..

Il est à noter que, de façon générale, on utilise le plus souvent la majuscule pour référer à un genre bactérien. La forme avec minuscule est considérée comme rare et non normative.

Genre de bactéries de la famille des Pseudomonadaceae, qui, par leur capacité de nitrification, jouent un rôle très important en fixant l'azote atmosphérique, participant ainsi à la fertilisation des sols.


hyperthermophile

Composé de thermophile et du préfixe hyper-.

Organisme qui peut optimalement vivre et se multiplier à des températures supérieures à 80 °C.

Les hyperthermophiles, ces organismes qui vivent à des températures largement supérieures à 80°C, se protègent de la chaleur grâce à un dispositif complexe, formé de protéines dont on a montré qu’elles n’ont que 5 millions d’années.

Jean-Luc Goudet, Bactéries à l’arsenic : « non, ce n’est pas une nouvelle forme de vie », futura-sciences.com, 6 décembre 2010


boîte de Pétri

(Date à préciser) Du nom du bactériologiste allemand Julius Richard Petri, qui inventa ce dispositif vers 1887, lorsqu’il était l’assistant du docteur Robert Koch.

https://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/LL-Q150 (fra)-WikiLucas00-boîte de Pétri.wav

Boîte cylindrique transparente peu profonde, en verre ou en plastique, munie d’un couvercle.

Facilement manipulable, empilable et peu coûteuse, la boîte de Pétri est utilisée pour la mise en culture de micro-organismes, de bactéries ou de cellules d’organismes supérieurs.

Ces versions miniatures des glandes lacrymales de souris et d'humain ont été cultivées dans une boîte de Petri.

Radio-Canada, Des glandes lacrymales humaines fabriquées en laboratoire, radio-canada.ca, 19 mars 2021


type trophique

Manière dont un organisme vivant constitue sa propre matière organique.


sagittariidés

Du latin scientifique Sagittariidae.Dérivé de sagittarius (« sagittaire (nom de l'espèce d'oiseau dont le terme générique français est messager »), avec le suffixe -idae (« apparentés au »), littéralement « apparentés au sagittaire ».

(Protozoaires) Famille de protistes ciliés voisins des colpodes et des paramécies, appartenant à l'ordre des Cyrtolophosidida, au sein de la classe des colpodées.


coliforme

De coli, groupe de la bactérie Escherichia coli et de forme.

Se dit d'une bactérie présente dans les intestins humains.


coliforme

Bactérie présente dans les intestins humains.

La présence de coliformes dans l’eau indique une contamination d’origine fécale.

C’est le deuxième exemple, d’eau de puits contaminée par une fosse d’aisance ne contenant pas de coli vrai, mais un coliforme liquéfiant la gélatine et de nombreux anaérobies.

Annales de l’Institut Pasteur, Volume 29, 1915


BEA

Bile Esculine Azide (gélose), un milieu de culture.


bactériome

De bactérie avec le suffixe biologique -ome.

Organe spécialisé présent chez certaines espèces d'insectes (e.g. mouche pisseuse (Homalodisca vitripennis), cochenilles diaspines (Diaspididae), etc.) abritant, au sein de cellules particulières appelées bactériocytes, des bactéries endosymbiotiques procurant à l'hôte des nutriments indispensables (e.g. vitamines, acides aminés essentiels, etc.) en échange de la protection et du ravitaillement en substrats énergétiques et constitutifs (glucides, lipides, etc.) que leur procure l'insecte hôte.

Ceux-ci, des bactéries spécialisées, sont inclus dans le cytoplasme des cellules d’un organe appelé bactériome, logé dans l’abdomen.

Les insectes s’entr’aident, mais toujours par intérête !, Science magazine nᵒ 41, 2014, page 50

Un mycétome est essentiellement un bactériome abritant des levures endosymbiotiques au lieu de, ou en plus de bactéries.


amphibiose

Mot dérivé de amphibie et du suffixe -ose.

Relation symbiotique qui, dans certaines circonstances, peut être bénéfique et, dans d'autres circonstances, peut être nocive ; les caractères bénéfiques et nocifs se référant à l’hôte ou au symbiote (relation dynamique).


anatoxine

Molécule dérivée d’une toxine de micro-organisme caractérisée par la perte de ses propriétés toxiques tout en ayant conservé sa structure et des propriétés immunisantes.

Depuis cette époque-là, une certaine controverse franco-anglaise est née pour définir qui, d’Alexander Glenny ou de Gaston Ramon, a découvert en premier l’anatoxine.

Mohamed Naceur Krifi, Naissance et essor de la vaccinologie et de l’immunothérapie, 2017


sang des glaciers

(Date à préciser)Composé de sang et de glacier, sang à cause de l’aspect et de la couleur rouge de ces algues.

https://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/LL-Q150 (fra)-Jérémy-Günther-Heinz Jähnick-sang des glaciers.wav

(Phycologie) Nom vernaculaire d’algues des neiges responsables de ces colorations grâce à l’astaxanthine, leur pigment rouge photoprotecteur.

Une fois au pied du glacier alpin, les cyclistes apercevront peut-être de curieuses taches rouges semblables à du sang, nichées au cœur de la neige d’une blancheur immaculée. Ces marques ne sont pas l’empreinte d’un crime, mais révèlent la présence de l’algue des neiges, plus communément appelée sang des glaciers.

Agnès ROUX, En vidéo : l’algue des neiges se dévoile aux grimpeurs du tour sur www.futura-sciences.com, 18 juillet 2013

Les glaciers habillent les hauts sommets ou les zones polaires d’un manteau blanc, et de temps en temps ils sont même noirs, car recouverts par des dépôts de roches et par la pollution. Mais, au printemps, ils prennent parfois une couleur rose pastel, presque rouge, pouvant surprendre ou émerveiller. Cette coloration résulte du développement d’une algue surnommée « sang des glaciers » […]

Jean-François Buoncristiani, Pascal Neige, 101 merveilles de l'évolution…, Dunod, 2017, page 170


algue des neiges

https://commons.wikimedia.org/wiki/Special:FilePath/LL-Q150 (fra)-Jérémy-Günther-Heinz Jähnick-algue des neiges.wav

sang des glaciers

algues des neiges de couleurs rougeâtres

Nom vernaculaire de différentes espèces de micro-algues vertes unicellulaires, de couleurs tirants du rouge au vert.


colpode

(1891) Du latin scientifique Colpoda, nom du genre, dérivé du grec ancien κολπω`δης, kolpô’dès (« sinueux, ayant des replis »).

Il existe une confusion considérable autour de l’identité des microorganismes appelés "colpodes" dans les textes n’employant pas la nomenclature scientifique pour dissiper l’ambiguité fréquente des noms vernaculaires lorsque employés seuls. Ainsi, bien que le cilié Colpidium colpoda (sens 2) ait été décrit en 1829, soit après les ciliophores ubiquitaires du genre Colpoda (sens 1), d’abord décrits par O.F. Müller (1773), il a été historiquement le premier cas d’emploi en français du terme colpode, devançant ainsi l’emploi de colpode pour décrire les espèces du genre Colpoda, pourtant plus communes et ubiquitaires. La similitude apparente des deux cas d’emploi du nom de colpode dans la nomenclature linnéenne des ciliés ne réflète cependant pas une parenté congrue entre les deux types de protozoaires, qui sont relativement éloignés sur le plan phylogénique. Ces facteurs, en plus de la double similitude de consonance, dans le cas de Colpidium colpoda, avec le cas des ciliés du genre Colpoda, a résulté en une très grande confusion dans les textes français n’employant que le nom vernaculaire de colpodes. Très souvent, seul le contexte permet de distinguer de quel type de protozoaire il s’agit, a fortiori en raison de la très grande abondance et de la fréquence d’observations des colpodes Colpoda spp. (ce qui serait, tel que formulé ici, une manière simple, avec l’alternative (i.e. colpodes Colpidium colpoda) de lever l’ambiguité sur le sens approprié de colpode).

En biologie, le genre, premier mot du nom binominal et les autres noms scientifiques (en latin) prennent toujours une majuscule. Par exemple, pour l’être humain moderne : Homo sapiens, famille : Hominidae. Quand ils utilisent des noms en français, ainsi que dans d’autres langues, les naturalistes mettent fréquemment une majuscule aux noms de taxons supérieurs à l’espèce (par exemple : les Hominidés, ou les hominidés).
Un nom vernaculaire ne prend pas de majuscule, mais on peut en mettre une quand on veut signifier que l’on parle non pas d’individus, mais de l’espèce (au sens du couple genre-espèce), du genre seul, de la famille, de l’ordre, etc.

(Protozoologie) Genre de protozoaires ciliés (Colpoda spp.) de la classe des colpodéens (Colpodea) et de la famille des colpodidés (Colpodidae), extrêmement communs – et probablement les ciliés les plus abondants en eau douce sur la planète et ce, jusqu’aux confins de l’Antarctique – se multipliant à partir de kystes dès que s’accumulent à peine quelques microlitres d’eau douce et s’enkystant dès que l’eau s’évapore en un cycle et un écosystème des plus simples mais aussi des plus efficaces.

Quand on fait macérer des fragments de crânes humains, on obtient des animalcules différents selon la race de l’individu : […] d’un crâne d’homme contemporain, il naît des colpodes […]

Jean Rostand, La Genèse de la vie, Hachette, Bordeaux, 1943, p. 87

Parmi les infusoires, les colpodes ont surtout été bien étudiés par Coste, Gerbe et Balbiani. Ce sont des infusoires ciliés pourvus d’une bouche, d’une poche stomacale et d’un estomac (fig. 1, e). Quand on observe ces colpodes dans une […]

Henri Étienne Beaunis, Nouveaux éléments de physiologie humaine: Prolégomènes - chimie physiologique, physiologie générale, Baillière, Paris, 1888, p. 26

(Protozoologie) Espèce de protozoaires ciliés (Colpidium colpoda) apparentée aux paramécies du type Tetrahymena, appartenant à la classe des Oligohymenophorea et à la famille des Tetrahymenidae.


mycétome

(XIXᵉ siècle) Composé de mycéto, variante de myco-, et de -ome.

Organe spécialisé présent le long du tube digestif chez certains insectes (par ex. anoploures, tipules, etc.) abritant, au sein de cellules particulières appelées mycétocytes, des levures endosymbiotiques en population mixte (c.-à-d. comprenant aussi des bactéries) ou non, et procurant à l’hôte des nutriments indispensables (par ex. vitamines, acides aminés essentiels, etc.) en échange de la protection et du ravitaillement en substrats énergétiques et constitutifs (glucides, lipides, etc.) que leur procure l’insecte hôte.


bactériostase

Inhibition de la multiplication de bactéries sans les tuer.

Les antiseptiques et désinfectants sont capables d’inhiber le développement des micro-organismes (bactériostase, fongistase, virustase) ou d’avoir une action létale (bactéricidie, fongicidie, virucidie, sporicidie) selon différents mécanismes d’action : coagulation des organites intracellulaires, altération des membranes…

Pascal Combemorel, Antiseptiques, antibiotiques, désinfectants : quelles différences ?, Planet-Vie, ENS, 29 septembre 2016


fongistase

Inhibition de la multiplication et du développement de champignons, sans les tuer.


virustase

Inhibition de la multiplication et du développement de virus, sans les tuer.


bactériocyte

Du préfixe bactério- apposé au suffixe -cyte.

Type d’adipocyte spécialisé que l'on retrouve dans le bactériome — organe spécialisé présent chez certains insectes (e.g. mouche tsé-tsé, cochenilles diaspines, blatte, etc.) — et qui héberge et nourrit des bactéries endosymbiotiques qui, en échange de substrats trophiques (glucides, lipides, etc.), procurent à l’hôte des nutriments indispensables (e.g. vitamines, acides aminés essentiels, etc.).

Dans une étroite relation symbiotique, le bactériocyte fournit à la fois la barrière nécessaire à protéger l'insecte hôte d’une prolifération incontrôlée des symbiotes bactériens qu’il héberge, et l’intermédiaire via lequel l’insecte extrait les nutriments essentiels de la bactérie, et cette dernière, les substrats énergétiques élaborés par le métabolisme de l’hôte.

Dans un bactériocyte, chaque bactérie est entourée d’une membrane qui provient de l’hôte et qui forme une vacuole : le symbiosome.

Pascale Cossart, La Nouvelle Microbiologie: Des microbiotes aux CRISPR, 2016


mycétocyte

Du grec ancien μύκητος, mýketos (« champignon ») suivi du suffixe -cyte, littéralement, « cellule à champignon ».

Type d’adipocyte spécialisé que l’on retrouve dans le bactériome ou mycétome —organe spécialisé présent dans le tube digestif de certains insectes (par ex. mouche tsé-tsé, cochenilles diaspines, etc.)— qui héberge et nourrit des bactéries ou des levures endosymbiotiques qui, en échange de substrats trophiques (glucides, lipides, etc.), procurent à l’hôte des nutriments indispensables (par ex. vitamines, acides aminés essentiels, etc.).

Le mycétocyte se distingue du bactériocyte en ce que ce dernier héberge uniquement des eubactéries, tandis que le premier peut servir d’environnement intracellulaire également à des levures, soit à l’exclusion de bactéries, soit en populations mixtes.

Sulc les a désignés sous le nom de mycétome, en réservant aux cellules remplies de levures, celui de mycétocyte.

Louis Amouriq, Rapports entomologo-cryptogamiques : éléments sur les relations entre insectes et champignons, 1973


xylophile

(Date à préciser) Motcomposé de ξύλον, xúlon (« bois ») et de φίλος, phílos (« ami, amateur »), littéralement « qui aime le bois ».

Se dit d'organismes (insectes, champignons, bactéries, etc.) dont l'environnement ou substrat habituel est la matière ligneuse (ou bois), sans nécessairement s'en servir comme aliment (ce qui se dirait alors xylophage).

Les insectes, les champignons xylophiles.

Des catastrophes ont pu se produire; les enquêtes sont probablement restées infructueuses; on n'a pas soupçonné la vraie responsable : une Abeille xylophile, simplement.

Robert Hardouin, La vie des abeilles solitaires, Gallimard, S.P., 1948, page 178


xylophile

Genre de protéobactéries de la famille des Comamonadaceae, agent responsable de la nécrose bactérienne de la vigne.


phyllosphère

Ensemble des parties des plantes situées au-dessus du niveau du sol et considéré comme habitat pour les micro-organismes.

La plus grande partie de la phyllosphère est constituée de feuilles vertes.


métadhérine

(2004) De l'anglais metastasis adhesion protein, protéine d'adhésion métastatique.

En 2004, une équipe de chercheurs de l’université de Princeton avait identifié un gène impliqué dans le cancer du sein métastatique : la métadhérine, ou MTDH.

Claire Manière·, Découverte d’un composé capable de désactiver le gène responsable des métastases des principaux cancers, 2021


axopode

(XXᵉ siècle)Dérivé de axe, avec le suffixe -pode.

Expansion cytoplasmique rigide de certains actinopodes, longue et fine.

La baguette stéréoplasmique a la propriété de pouvoir se résorber presque instantanément en permettant ainsi la rétraction de l’axopode.

André Schaaf, Les radiolaires du crétacé inférieur et moyen, 1984, page 26

Dans les pseudopodes de beaucoup d’Héliozoaires et de certains Radiolaires il y a un filament axial ou axopode qui est l’élément contractile.

Auguste Prenant, Les Appareils ciliés et leurs dérivés, page 194, 1913


éjectosome

Du latin ejectio (« action de jeter au dehors ») et du suffixe -some, du grec ancien σῶμα, sôma (« corps »).

Organite éjecteur dont le rôle est d’évacuer le contenu de la cellule, chez les protozoaires et les algues microscopiques, notamment les Cryptophyceae

Chez le Campylomonas un sillon longitudinal s’étend postérieurement à partir du vestibulum et se transforme en un gosier en forme de sac, tapissé de nombreuses rangées d’éjectosomes.


exopolysaccharide

Dérivé de polysaccharide, avec le préfixe exo-.

Polymère composé de résidus de sucre, sécrété par un micro-organisme dans le milieu environnant.


dinokyste

Stade dormant et zygotique du cycle de vie de certains dinoflagellés.

Une fois les carottes récupérées, j’ai recours à l’étude de deux bio-indicateurs organiques piégés dans les sédiments : un continental - les grains de pollen - et l’autre marin - les dinokystes. Au cours de leur vie, certaines espèces de dinoflagellés produisent des kystes qui peuvent leur permettre de repeupler leur environnement plus tard, après une phase dite de dormance.

Adrien, Pourquoi les algues toxiques envahissent-elles la rade de Brest ?, www.techno-science.net, 14 février 2022


intracytoplasmique

Étymologie manquante ou incomplète. Si vous la connaissez, vous pouvez l’ajouter en cliquant ici.

intracytoplasmiques (plural masculine feminine)


cinétosome

Du grec ancien κινετο, kineto (« (se) mouvoir ») et grec ancien σῶμα, sôma (« corps »).

Organite intracellulaire d'où est issu un cil ou un flagelle chez certains organismes unicellulaires.

Le corps de cet infusoire est uniformément recouvert de cils insérés chacun sur un corpuscule basal appelé cinétosome

R. Husson & F.Graf. Manuel de biologie générale à l'usage des Travaux Pratiques. Fascicule 1: la cellule, 1965, page 45.


micromanipulateur

Dérivé de manipulateur, avec le préfixe micro-

Appareil qui permet de réduire l’amplitude des mouvements pour manipuler du matériel à petite échelle.


aéroplancton

Ensemble des organismes microscopiques vivants (bactéries, virus, spores de champignons, pollen, microalgues, etc.) en suspension dans l’air.

Au hasard de son voyage le pollen a une chance très faible de rencontrer une fleur. L’ensemble des pollens ainsi élevés dans les airs et transportés par les vents constitue l’aéroplancton.

Mémoires du Muséum national d'histoire naturelle, 1973


mycobiote

(Date à préciser)Dérivé de biote, avec le préfixe myco-.

Population de champignons micromycètes vivant en accord avec son hôte.

Le mycobiote est une composante d’un ensemble plus grand, le microbiote, composé des bactéries, archées, champignons, protozoaires (parasites) et virus qui colonisent différents écosystèmes du corps humain.

Marc Gozlan, « Le mycobiote, une partie du peuple invisible du corps humain », Le Monde, 2 janvier 2023

De même que nos bactéries, nos champignons nous sont utiles. L'équilibre du mycobiote est nécessaire au bon fonctionnement de certaines voies métaboliques.

Julien Hernandez, « Moins connu que le microbiote : le mycobiote intestinal », Futura, 20 mars 2021

Ainsi, le mycobiote des plantes est constitué d’une diversité de champignons recrutés par transmission verticale via les graines ou par voie horizontale, depuis le sol ou l’air où abondent les spores de champignon, puisque chaque mètre cube d’air en contient de 1,000 à 10,000 ! Mais les plantes ne sont pas les seules à présenter un mycobiote : les animaux aussi !

Liam Laurent-Webb, Marc-André Selosse, « Quand les champignons et les plantes coopèrent : découvrez le mycobiote », The Conversation, 23 mai 2024


pathovar

pv.

sigle utilisé en conventions internationales

Souche ou groupe de souches de bactéries pathogènes des végétaux. Il s'agit d'une catégorisation faite par type de symptômes et/ou par type de plantes infectées et non sur des critères génétiques.

Le pathovar corylina se développe sur le noisetier. Le pathovar cucurbitae infecte les Cucurbitaceae et contamine les graines à l'intérieur du fruit. Le pv. glycines induit la maladie des « pustules bactériennes » chez le soja.

Jean Semal , Traité de pathologie végétale, éd. Les Presses Agronomiques de Gembloux, 1989.


bactérie miroir

(Date à préciser)Composé de bactérie et de miroir.

Spéculation scientifique sur la possibilité d’avoir des bactéries dont la chiralité du matériel génétique (ADN, ARN) et des protéines serait inversée.